中标后甲方还能质疑吗

可以质疑。中标候选人公示期内，投标人或其他利害关系人如对中标候选人或评标有异议，可以向招标人或招标代理机构提出。招标人在收到异议之日起三日内做出答复。招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起三十日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同。
法律依据：
《招标投标法》第四十六条
招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起三十日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同。招标人和中标人不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。招标文件要求中标人提交履约保证金的，中标人应当提交。